Stage de M2 en Pathologie Végétale H/F

L'offre

Sujet du stage
Evaluation de l'agressivité et de la spécificité de différentes souches d'Alternaria Brassicicola sur chou-fleur et chou romanesco.

Contexte
La maladie fongique causée par certaines espèces du genre Alternaria (A. brassicae, A. brassicicola...) sur chou-fleur et chou romanesco se caractérise par des taches rondes brunes sur les feuilles ainsi que par des nécroses brunes ou noires sur la pomme. Cette maladie impacte le rendement, mais surtout la qualité des choux, pouvant ainsi empêcher leur commercialisation. Le pathogène se développe dans des conditions chaudes et humides, ce qui pourrait en faire une problématique majeure dans un contexte de réchauffement climatique, notamment dans une région comme la Bretagne.
Il est donc essentiel de développer des variétés résistantes à cette maladie, devenue prépondérante dans la région ces dernières années. Pour cela, il est envisageable de
développer des marqueurs moléculaires ciblant la résistance contre Alternaria. Pour ce faire, il est nécessaire de réaliser des essais variétaux en conditions contrôlées en laboratoire mais également de développer nos connaissances sur le pathogène en amont.

Objectifs
Que ce soit pour le criblage variétal ou pour le développement de marqueurs moléculaires, il est nécessaire de développer un protocole robuste et fiable pour l'inoculation des plantes en conditions contrôlées. La première étape est de mieux
connaitre les pathogènes responsables de la maladie et présents dans la région afin de cibler les souches qui vont être utilisées pour les essais. Sur la saison 2025-2026, un échantillonnage d'environ 200 isolats d'Alternaria a été réalisé dans la région Bretagne Il a été démontré que les isolats pouvaient avoir une
agressivité très différente, certains pouvant provoquer des symptômes beaucoup plus développés que d'autres sur chou-fleur en conditions contrôlées.
Sachant que les isolats d'Alternaria ont été prélevés sur chou-fleur et chou romanesco, à la fois sur les feuilles et sur les pommes, on peut se demander si l'origine du prélèvement
peut influencer l'agressivité de l'isolat. En d'autres termes, un isolat prélevé sur choufleur sera-t-il plus agressif sur du chou-fleur et inversement pour le romanesco ? La même question peut se poser également en fonction de l'organe concerné, feuille ou
pomme.
Répondre à ces questions pourra permettre de mieux comprendre la dynamique d'infection du pathogène et de savoir quelles souches et quel protocole utiliser pour les essais variétaux.

Approches méthodologiques
Différents isolats provenant de chou-fleur ou de chou romanesco et ayant été prélevés soit sur les pommes ou les feuilles de choux seront sélectionnés dans la collection. Des inoculations seront alors réalisées avec ces isolats sur feuilles ou pommes de chou-fleur et de romanesco. Grâce aux notations réalisées à la suite de ces inoculations, l'agressivité de chaque isolat pourra être évaluée et le lien entre l'agressivité et l'origine du prélèvement sera étudié.

Profil recherché

Ce stage demande de la méthode, de la précision et une bonne lecture des résultats. Au quotidien, il faut des bases solides et des gestes sûrs.

• Formation en biologie végétale, pathologie végétale et microbiologie, avec un niveau M2 attendu.
• Aisance en analyse de données et en statistiques pour traiter les notations.
• Rigueur dans les manipulations, le suivi des inoculations et les relevés.
• Sens de l'observation et capacité à interpréter des symptômes sur plantes.
• Capacité à travailler en laboratoire avec méthode, autonomie et régularité.
• Permis B indispensable, avec véhicule personnel pour accéder au site.

Bon à savoir

Période de stage
6 mois de janvier à juin ou de mars à août

Equipe d'accueil : Laboratoires et Serres
Responsable : Benoit Borschinger
Encadrant :

• JAMMES Margaux
• Chef de projet Laboratoires et création variétale

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