Stage Bac +2 - 3 Etude de la Dynamique des Micro-Organismes Marins du Lagon Sud de la Nouvelle-Calédonie Approches de Biologie Moléculaire H/F

L'offre

L'unité LEAD-NC (Lagon, Ecosystèmes et Aquaculture Durable en Nouvelle-Calédonie) fait partie de l'UMR Entropie depuis janvier 2020. L'objectif global de cette UMR est d'analyser les ressources littorales et marines ainsi que la biodiversité dans la zone Indo-Pacifique tropicale, afin d'étudier leur dynamique et leur sensibilité face aux pressions naturelles et humaines, tout en créant des instruments pour la conservation, la gestion et la valorisation durable.

L'unité Ifremer LEAD cible ses recherches sur la santé et la dynamique des agrosystèmes et des écosystèmes lagonaires à différentes échelles, selon trois axes :

• La dynamique des forçages du milieu pendant les phénomènes intenses (dépressions tropicales, canicules marines, par exemple).
• La structure et la diversité des microbes environnementaux sur le continuum terre-mer intégrant les agrosystèmes.
• La réponse de l'holobionte (plasticité phénotypique, limites physiologiques d'espèces d'intérêt aquacole ou écologique) face à ces perturbations.

Inscrit au Patrimoine mondial de l'UNESCO depuis 2008, le lagon calédonien englobe le lagon Sud, espace d'importance majeure sur les plans écologique et patrimonial grâce à ses récifs et sa biodiversité. Cet environnement subtropical abrite une diversité exceptionnelle de micro-organismes (bactéries, micro-algues) indispensables au fonctionnement de l'écosystème, notamment pour la production primaire, la régulation des cycles biogéochimiques et le recyclage de la matière organique.

Dans un contexte de changement global, la hausse en fréquence et en intensité des vagues de chaleur marine (MHW) perturbe les communautés microbiennes (archées, bactéries, protistes). Ces hausses brutales de température de l'eau peuvent avantager des espèces opportunistes et déséquilibrer l'écosystème. Intégrée au projet interdisciplinaire MAHEWA en lien avec l'IRD, cette étude vise à analyser la dynamique de ces populations, comprendre leur résilience et repérer des bioindicateurs précoces de l'état de santé du lagon et des récifs.

Le sujet porte sur l'étude de la dynamique des micro-organismes marins du lagon sud par biologie moléculaire, avec l'optimisation et la mise en œuvre de protocoles PCR/qPCR pour détecter des organismes d'intérêt écologique ou pathogènes.

Tes missions

La finalité est de maîtriser les outils de biologie moléculaire, du traitement des données jusqu'à la préparation de l'échantillon. Les activités confiées comprennent :

• Préparer et filtrer les prélèvements de terrain au moyen d'un système de filtration type Büchner.
• Effectuer des extractions d'ADN et d'ARN.
• Optimiser les démarches de quantification et de détection par PCR/qPCR sur des échantillons d'ADN environnemental.
• Réaliser des électrophorèses sur gel d'agarose après la PCR.

Profil recherché

Ce stage s'adresse aux étudiants préparant un diplôme tel que :

• BTS biotechnologie ;
• Licence SVT ;
• BUT génie biologie.

Bon à savoir

Informations relatives à l'organisation du stage :

• Lieu : centre Ifremer de Nouméa (Nouvelle-Calédonie).
• Période et durée : stage de 3-4 mois à effectuer entre janvier et décembre 2026.
• Transport : les billets d'avion pour le trajet France/Nouvelle Calédonie/France restent à la charge du stagiaire.
• Rémunération : gratification selon le niveau d'études (660 euros pour un mois plein), complétée par une indemnité repas de 87 euros par mois.
• Candidature : date limite fixée au 27/11/2026.